Keadaan yang mengakibatkan kekurangan tiamina, dan kesannya termasuk ketagihan alkohol kronik dan kekurangan zat makanan teruk.[16] Alkoholisme mungkin berlaku bersama dengan pemakanan yang tidak baik, dan sebagai tambahan kepada keradangan lapisan perut, menyebabkan kekurangan tiamina.[17] Punca lain termasuk kekurangan diet, muntah berpanjangan, gangguan makan dan kesan kemoterapi. Ia juga boleh berlaku pada wanita hamil yang mempunyai bentuk mabuk pagi melampau yang dikenali sebagai hiperemesis gravidarum.[18] Keracunan merkuri juga boleh menyebabkan sindrom Korsakoff.[19] Walaupun ia tidak selalu berlaku bersama, gangguan ini boleh muncul dengan kerap sebagai akibat akibat ensefalopati Wernicke.[20]

Imbasan PET menunjukkan bahawa terdapat penurunan metabolisme glukosa di bahagian frontal, parietal dan singuat otak pada mereka dengan sindrom Korsakoff. Ini boleh menyumbang kepada kehilangan ingatan dan amnesia. Pengimejan saraf struktur juga telah menunjukkan kehadiran lesi diensefalon garis tengah dan atrofi kortikal.[9]

Lesi struktur sistem saraf pusat, walaupun jarang berlaku, juga boleh menyumbang kepada gejala KS. Kerosakan teruk di nukleus dorsal medial secara pasti mengakibatkan defisit ingatan. Selain itu, autopsi orang yang mempunyai KS telah menunjukkan lesi di kedua-dua garis tengah dan talamus anterior, dan infarksi talamus. Infarksi dua hala kepada talamus juga boleh mengakibatkan amnesia yang disebabkan oleh Korsakoff. Penemuan ini membayangkan kerosakan pada nukleus talamus anterior boleh mengakibatkan ingatan yang mengganggu.[21][22]